La decisione di aprire il portello della botola causa un diverbio tra Jack e Locke. Mentre sta cercando il cane di Walt, Shannon ha una spaventosa visione. Locke e Kate sfidano Jack e tornano alla botola. Jack li segue e fa una scoperta scioccante.
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Sawyer e Michael si ritrovano da soli in mezzo all'oceano su quello che resta della loro zattera, senza nessuna traccia di Walt o Jin. Claire parla a Charlie di una scoperta che ha fatto tra i suoi effetti personali. Locke e Kate affrontano l'uomo all'interno della botola e scoprono l'importanza dei numeri. Michael e Sawyer, in mezzo dell'oceano, mettono da parte le loro incomprensioni e cercano di raggiungere terra, dove li attendono altre difficoltà.
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Kate danneggia il computer della botola durante una lotta con Desmond. Desmond racconta a Jack e a Locke come sia arrivato sull'isola e mostra loro una pellicola che spiega il progetto "Orientation". Michael, Sawyer e Jin sono imprigionati insieme ad una donna che avevano già visto all'aeroporto. Desmond si allontana dalla botola, lasciando Jack e Locke in disaccordo. Sayid si affretta a riparare il computer in tempo per digitare i numeri e "salvare il mondo".
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Hurley teme che la sua nuova attività faccia di lui l'uomo più odiato dell'isola. Sawyer, Jin e Michael scoprono che i loro rapinatori sono i sopravvissuti che si trovavano nella coda dell'aereo. Claire trova il messaggio nella bottiglia proveniente dalla zattera e le sue paure e quelle di Sun aumentano. L'esplorazione della botola di Sayid solleva dei sospetti.
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